تاریخ بروزرسانی : 1398/07/12
نام بسته درسی : ساختار DNA و همانندسازی
————————————————————
فهرست:
کروماتین
فراساختار کروماتین
ساختار سولنوئیدی
ساختار زیگزاگی
انواع کروماتین
ساختار DNA
ساختمان نوکلئوزیدی
نیروهای پایدارکننده DNA
انواع DNA
DNA سه رشته ای
DNA چهاررشته ای
تکرار توالی های DNA یوکاریوتی
DNA سوپرکویل
پارامترهای کمی سوپرکویل
آنزیم های توپوایزومراز
آنزیم های نوکلئاز یا فسفودی استراز
آنزیم های محدود الاثر(Restriction Enzymes)
تکنیک های تعیین توالی نوکلئوتیدی DNA
همانند سازی DNA
محل شروع همانند سازی در پروکاریوت ها
انواع آنزیم های DNA پلیمراز پروکاریوتی
مرحله ادامه همانند سازی در پروکاریوت ها
پایان همانند سازی در پروکاریوت ها
الگوهای مختلف همانند سازی مولکول DNA حلقوی
همانند سازی در سلول یوکاریوتی
عوامل دخیل در همانند سازی DNA یوکاریوتی
آسیب های DNA و مکانیسم ترمیم بیولوژیکی
مکانیسم های ترمیم بیولوژیکی DNA
روش حذف نوکلئوتیدی
ترمیم جفت باز های ناجور
ترمیم AP یا روش حذف باز آسیب دیده
ترمیم پس همانند سازی یا نوترکیب
پاسخ SOS
کروموزوم ها واجزای آنها
انواع کروموزوم از نظر تعداد سانترومر
کروموزوم های غیر معمول
کروموزوم های مصنوعی
پلاسمید ها
ژنوم باکتریوفاژها
استراتژی همانندسازی ژنوم باکتریوفاژها
ژنوم ویروس های یوکاریوتی
عناصر ژنتیکی متحرک
جابجایی از طریق RNA واسط
ترانسپوزون های RNA فاقد LTR
DNA ترانسپوزون ها
نوترکیبی
آزمون خودسنجی با پاسخ
بخش هایی از بسته درسی ساختار و همانند سازی
کروماتین
کروماتین ترکیب اصلی هسته و ماده ژنتیکی سلول های یوکاریوتی می باشد و در حقیقت حالت بسیار کم متراکم شده ای از کروموزوم است. ترکیبات شیمیایی کروماتین عبارتند از:
الف-هیستون ها: که از پروتئین های به شدت قلیایی غنی از اسیدهای آمینه بازی به خصوص لیزین و آرژنین می باشند. هیستون ها دارای بار مثبت بوده و بدین ترتیب میل ترکیبی آنها با DNA بخاطر وجود بارهای منفی گروههای فسفات زیاد می باشد و تشکیل DNH(مجموعه هیستونها و DNA که توسط پیوند های الکترواستاتیک به هم پیوند شده اند) را می دهند.
وزن مولکولی هیستون ها 6-23 کیلودالتون است و شامل H2A، H2B، H3و H4و H1 هستند. H5 از اریتروسیت های جوجه و برخی ماهی ها جدا کرده اند. H5شباهت زیادی به H1 دارد ولی مقدار آرژنین آن بیشتر است. هر دو خارج از اکنامر هیستونی قرار می گیرند و در بخش DNA رابط وجود دارند.
هیستون ها ثبات زیادی دارند زیرا طی تکامل گونه ها، توالی ها و نوع اسیدآمینه های آنها ثابت مانده است.هیستون H1همانطور که اشاره شد در ساختمان اکتامر هیستونی قرار می گیرد و نوکلئوزوم را می پوشاند. H1 دارای زیرواحدهای A،B،C است که از نظر ترتیب اسیدهای آمینه مشابه ولی از نظر میزان لیزین نابرابرند.در فشردگی DNA، H1A نقش بیشتری را نسبت به H1C دارد.H1 در ایجاد شکل فضایی کروماتین، به هم پیوستن نوکلئوزوم ها و ایجاد پیچش های کروماتین نقش دارد. به هر نوکلئوزوم فقط یک مولکول H1 متصل است.
نسبت آرژنین به لیزین را در هیستون ها شاخص هیستونی می گویند. mRNA هیستونی در انتهای3’ خود فاقد دنبالهpolyA است و همچنین در ژنوم هیستونی اینترون وجود ندارد و ژن های هیستونی به صورت توالی های تکراری و پشت سر هم دیده می شوند.
ب- غیر هیستون ها: این پروتئین ها تنوع زیادی دارند و تا کنون 400 نوع از آنها ناشناخته است. این پروتئین ها غنی از اسیدهای آمینه اسیدی هستند و به خاطر وجود بار منفی با هیستونها درگیر شده و ضمن خنثی کردن بارهای مثبت آنها موجب رهایی هیستون ها از DNA می شوند. این عمل در فعال کردن ژنها و امکان رونویسی آنها نقش بسزایی را ایفا می کند.
غیر هیستون ها از پروتئین های بسیار مهمی در تمایز سلولی و تشکیل بافت ها می باشند که آنها را گروه پروتئینی پرتحرک یا HMGs یا High Mobility Group Proteins می نامند. نام اینها از حرکت بالای الکتروفورتیکی آنها گرفته شده است. غیر هیستون ها به دو گروه کلی تقسیم می شوند:
غیر هیستون های ساختاری:
که در ساختار کروماتین وارد شده و در حقیقت بخش مهمی از اسکلت کروموزومی را تشکیل می دهند.پس از جداسازی هیستون ها که با استفاده از ترکیبات پلی آنیونی قابل رقابت با پروتئین های بازی، مثل سولفات دکستران انجام می سود، اسکلت کروماتیدها بصورت محور میانی متراکمی دیده می شود که حلقه هایی از DNA کروماتیدی به دور آن کشیده شده است. این محور کروموزومی که رشته های کروماتینی، اطراف آن سازمان می یابند از پروتئین های غیر هیستونی ساختاری تشکیل شده است.
غیر هیستون های آنزیمی:
بسیار متنوع بوده و شامل DNA پلیمراز ها، RNA پلیمرازها، اگزونوکلئازها، اندونوکلئازها، هلیکازها و توپوایزومرازها می باشند.
پروتامین ها از سلول های بازی در سلول های زایشی و جنسی هستند و با افزایش مقدار خود، سلول را به سمت گامت شدن سوق می دهند. این پروتئین ها در ساختار کروماتین نیز دیده می شوند.
آزمون خودسنجی :
1.کدام عبارت درباره همانندسازی پروکاریوت ها صحیح است؟
2.DNA لیگازپروکاریوتی به کدام فاکتور نیاز دارد؟
پاسخ های تشریحی:
1-گزینه ج صحیح است
2-گزینه ج صحیح است
DNAلیگاز برای عمل خود در باکتری ها به NAD+ نیاز دارد ولی در یوکاریوت ها و پستانداران از ATP استفاده می کند.
نوشتههای تازه
آخرین دیدگاه ها